十七年，岑濬陷《田州府》。
按《明外史土司傳》：「十七年，濬掠上林、武緣等縣，死者不可勝計。又攻破田州府，猛以身免，濬擄其家屬五十餘人。總鎮以聞，兵部請調三廣兵勦之。」
十八年，總督潘蕃等討岑濬，誅之，思恩平。按《明外史土司傳》：「十八年，總督潘蕃、太監韋經、總兵毛銳，調集兩廣、湖廣官軍土兵十萬八千餘人，分為六哨，副總兵毛倫、右參政王璘由慶遠，右參將王震、左參將王臣及湖廣都指揮官纓由柳州，左參將楊玉、僉事丁隆由武緣，都指揮金堂、副使姜綰由上林，都指揮何」 清、參議詹璽由丹良，都指揮李銘、泗城州土舍岑接由工堯，各取道共抵賊巢。賊分兵阻險拒敵，官軍奮勇直前，援崖而進。濬勢蹙，遁入舊城。諸軍圍攻之，濬死。城中獻其首於軍門，思恩遂平。前後斬捕四千七百九十級，俘男女八百人，得思恩府印二，向武州印一。自進兵及班師僅踰月。捷聞，帝以蕃等有功，賜璽書勞之。
是年，改設流官，以廣西右參政張鳳掌思恩府事。
按《明外史土司傳》：「兵部議濬既伏誅，不宜再錄，其後應改設流官，擇其可者。於是以雲南知府張鳳陞廣西右參政，掌思恩府事，賜敕。」
世宗嘉靖四年，都御史盛應期討思恩蠻，平之。按《明外史土司傳》：「正德七年，增設鳳化縣治，時初設流官，諸蠻未服，覃恩、劉召相繼叛。嘉靖四年，都御史盛應期遣兵平之。」
六年，土司王受作亂，新建伯王守仁兵至，受乃降。
按《明外史王守仁傳》：「『嘉靖六年，思恩田州土酋盧蘇、王受反，總督姚鏌不能定，乃詔守仁以原官兼左都御史，總督兩廣兼巡撫。守仁在道疏陳用兵之非，且言思恩未設流官，土酋歲出兵三千，聽官征調。既設流官，我反歲遣兵數千防戍。是流官之設，無益可知』。章下兵部，尚書王時中條其不合者五，帝令守仁更」 議。十二月，守仁抵潯州，會巡按御史石金定招撫蘇受，初求撫不得，聞守仁至，益懼。至是則大喜。守仁赴南寧，二人遣使乞降，守仁令詣軍門。二人竊議曰：「王公素多詐，恐紿我。」 陳兵入見，守仁數二人罪，杖而釋之，親入營，撫其眾七萬。奏聞於朝，帝遣行人奉璽書獎諭。
按《土司傳》：「六年，土目王受與田州盧蘇謀煽亂，勢復熾。新建伯王守仁受命至，一意招撫，而檄受等破八寨」賊因列思恩地為九土巡檢司，管以頭目授王受白山司巡檢，比於世官。又以思恩舊治瘴霧昏塞，宜更之爽塏。於是擇地荒田驛以建新郡，割武緣。�二里益之。又議割上林三里而移鳳化縣治於其處，蓋寓犬牙相錯之意。
十三年，鎮安《岑真寶》伏誅。
按《明外史土司傳》：「嘉靖十三年，鎮安岑真寶詐岑濬子，謀并思恩，守備高乾督九司征之，誅真寶。」
十八年，土目盧回等作亂。
按《思恩府志》：「嘉靖十八年十二月，安定司土目盧回、黎德等，聚兵三千餘為亂，劫擄鄉村，勢甚猖獗。官兵追殺之，叛兵各聽招安。」
二十五年，東蘭州岑瑄叛，頭目黃才計殺之。按《明外史土司傳》：「自九司日恣，所轄蠻民不堪，知府陳璜曲加綏戢，目把劉觀、盧回等以復土為名，鼓眾煽亂。副使翁萬達因有事安南，計擒盧回殺之，招回九司，從亂者三十餘人。最後，東蘭岑瑄詐稱岑濬子起雲，謀復土官，卒為九司頭目所縛。」
按《思恩府志》：「岑瑄，東蘭州人。假稱岑濬，遣子起雲助兵，復糾集武緣永寧鄉狼民三百，改劫鄉村，九司集兵堵殺，退歸東蘭，頭目黃才等計誘擒殺之。」
神宗萬曆七年，以武緣縣屬「思恩府。」
按《明外史土司傳》：「萬曆七年，督撫吳文華謂九司日以驕黠，編氓甚少，緩急難恃，奏割南寧府武緣縣屬思恩。自是思恩稱巨鎮云。」
崇禎十五年，思恩府知府朱國杞平隆安賊按《思恩府志》：「崇禎十五年，隆安妖賊馬日僊，挾邪術鼓眾作亂，犯思恩府。本府知府朱國杞調土兵大破之，日僊就擒。」
皇清順治十七年，思恩府知府高向極等討土目張
常誅之
按《思恩府志》：「崇禎十八年，歸朝土州叛目張常。」
